تستخدم المضادات الحيوية لعلاج العدوى البكتيرية، ومن آثارها الجانبية قتل البكتيريا النافعة التي تعيش في الأمعاء، خصوصاً المضادات الحيوية واسعة الطيف، ويؤدي قتل البكتيريا النافعة إلى فقدان التوازن بين الميكروفلوا؛ حيث تتاح الفرصة لفطر المبيضات (بالإنجليزيّة:  Candida) المتواجد بصورة طبيعية في جسم الإنسان إلى التكاثر بصورة تفوق المعدلات الطبيعية، الأمر الذي يؤدي إلى الإصابة بالعدوى الفطرية وداء المبيضات، لذا قد ينصح بتناول المكملات الغذائية التي تحتوي على البكتيريا النافعة، أو منتجات الألبان لتعويض النقص الذي خصل نتيجة تناول المضادات الحيوية، خصوصاً فيحال ناولها لفترات طويلة.